许多微生物具有杀虫作用。已经报道的杀虫微生物有1700多种，包括细菌、病毒、立克次氏体和原生动物等。
目前用于杀虫的细菌主要是芽孢杆菌属中的一些种，如苏云金芽孢杆菌、球形芽孢杆菌和金龟子芽孢杆菌等。
（1）苏云金芽孢杆菌
苏云金芽孢杆菌是 目前唯一大规模工业化生产的微生物杀虫剂，也是世界上用途最广、产量最大的微生物杀虫剂。它对近600种昆虫和有害生物有活性，对100多种农林害虫及蚊蝇有很好杀灭效果。苏云金芽孢杆菌是一种好氧产芽孢的杆状细菌。它在形成芽孢的同时，在另一端形成伴孢晶体。伴孢晶体是一种蛋白质，在碱性条件下分解成有毒物质，和芽孢共同作用，产生很强的杀虫效果。它还能分泌β—外毒素、δ—内毒素、卵磷脂酶、壳多糖酶，对昆虫都有毒性。
苏云金芽孢杆菌杀虫剂可用液体深层或固体发酵获得不同规格的产品。
（2）球形芽孢杆菌
球形芽孢杆菌杀虫剂在灭蚊幼虫中发挥作用。它的主要活性成分是伴孢晶体中的毒素蛋 白。毒素蛋白由两种蛋白组成，它们共同参与才能起作用，因此为二元毒素。
（3）金龟子芽孢杆菌（即日本甲虫芽孢杆菌）
金龟子芽孢杆菌是一种金龟子幼虫（蛴螬）专性病原菌。金龟子芽孢杆菌感染蛴螬后，在中肠内萌发成营养体，穿过肠壁进入体腔，迅速繁殖，破坏各种组织，导致幼虫大量死亡。
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