正常菌群：生活在健康动物各部位，数量大、种类较稳定且一般是有益无害的微生物，称为正常菌群。
正常菌群与人体的关系：一般能维持平衡，菌群内部的各种微生物之间，也是相互制约而维持相对稳定。
变化情况：正常菌群是相对的、可变的、有条件的。
Ø机体防御机能减弱时，一部分正常菌群会成为病原微生物；
Ø正常菌群在非正常部位时也可引起疾病；
Ø由于外界因素的影响，破坏了各种微生物之间的相互制约关系，正常菌群也会引起疾病（菌群失调症）。
其它生物体
Ø无菌动物（germ-free animal）：体内外检查不到任何正常菌群的动物
Ø悉生生物（gnotobiotics）：已经人为接种某已知纯种微生物的无菌动物
Ø根际微生物（rhizosphere microorganism）：植物根系经常向周围土壤分泌各种外渗物质，故根际有大量微生物活动。种类组成受植物的种类和植物发育阶段影响。作用是改善植物营养、分泌生长刺激素及抗生素等；有时也有害，与植物争夺N、P等营养、分泌毒素等。
Ø附生微生物（epibiotic microbe）：指生活在植物体表面，主要借其外渗物质或分泌物质为营养的微生物。叶面微生物是主要的附生微生物。
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